CRISPR擴增子測序
CRISPR基因編輯技術(shù)不僅引起了基因編輯領(lǐng)域的一場革命,也為基因治療開辟了廣泛的應(yīng)用前景?;蚓庉嫷慕Y(jié)果可以采用DNA測序方法進行確認。當樣本或靶位點較多時,傳統(tǒng)的Sanger測序無法快速有效地鑒定基因編輯效率,適合采用高通量測序,即通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計引物,進行PCR擴增,然后對擴增子(amplicon)測序,可以快速高效地獲得目標區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠遠優(yōu)于一代測序。
泓迅生物根據(jù)不同的高通量測序平臺,可提供不同讀長的擴增測序服務(wù),用于CRISPR篩選文庫驗證、CRISPR編輯效率檢測等,幫助研究人員快速定位基因突變位點和研究基因功能。
服務(wù)優(yōu)勢
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- 一次上機可以進行數(shù)百到數(shù)千個擴增子的多重分析
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- 可用于各種突變驗證和篩選遺傳變異
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- 提供個性化的生物信息分析服務(wù)
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- 與全基因組測序相比,成本低周期短
服務(wù)詳情
擴增長度
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樣本要求
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測序平臺
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價格
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周期
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交付內(nèi)容
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70-280bp
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? 需要PCR 產(chǎn)物或者提取好的基因組
? 客戶富集好的靶向區(qū)域PCR產(chǎn)物,建議濃度大于10 ng/μL,總量1-5 μg,以Qubit 2.0檢測結(jié)果為準
? 客戶需要提供擴增引物以及參考序列
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Illumina 2×150 bp
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1500元起/5G
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3周
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? FASTQ格式的原始數(shù)據(jù)
? 數(shù)據(jù)分析報告
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280-480bp
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Illumina 2×250 bp
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咨詢
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服務(wù)流程
常見問題
1. 特異性問題:
gRNA(或crRNA)的設(shè)計至關(guān)重要,其準確性直接影響到CRISPR系統(tǒng)的特異性。設(shè)計不當可能導(dǎo)致非特異性切割,進而影響到非目標基因。因此,在選擇目標序列時,應(yīng)確保其特異性,并避免與非目標基因發(fā)生錯配。
2. Off-target效應(yīng):
CRISPR技術(shù)中的Cas9蛋白可能在目標位點以外的地方發(fā)生切割,即產(chǎn)生Off-target效應(yīng)。為減少這種效應(yīng),研究人員需要采用合適的技術(shù)來評估和減輕這些非特異性切割,例如通過全基因組測序來檢測潛在的Off-target位點。
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