真核轉錄組測序,針對特定組織或細胞在特定狀態(tài)下轉錄的所有mRNA進行測序,分為有參與無參兩類。有參測序通過與參考基因組比對,快速分析mRNA序列、豐度及基因結構,預測新轉錄本。無參測序則拼接出unigene作為參考,研究轉錄水平變化。該技術已廣泛應用于基礎研究、分子育種、臨床診斷和藥物研發(fā)等領域。
分析內容
|
有參考
1. 數(shù)據(jù)質控及統(tǒng)計
2. 參考基因組比對
3. 定量分析
3.1 定量結果
3.2 表達水平分布
3.3 相關性分析
4. 差異分析
4.1 差異基因
4.2 差異基因火山圖
4.3 差異基因聚類
5. GO/KEGG/Reactome富集分析
5.1 GO功能富集
5.2 通路富集結果
5.3 通路富集柱狀圖與散點圖
5.4 KEGG富集通路圖
5.5 Reactome富集分析
6. 差異可變剪切分析
|
無參考
1. 數(shù)據(jù)質控及統(tǒng)計
2. 組裝
3. 定量分析
3.1 定量結果
3.2 表達水平分布
3.3 相關性分析
4. 差異分析
4.1 差異基因
4.2 差異基因火山圖
4.3 差異基因聚類
5. GO/KEGG/Reactome富集分析
5.1 GO功能富集
5.2 通路富集結果
5.3 通路富集柱狀圖與散點圖
5.4 KEGG富集通路圖
5.5 Reactome富集分析
|
備注:人的樣品還可以分析融合基因,新轉錄本預測,轉錄因子分析和蛋白互作分析等。